📄 molecular biology

Illuminating the uncharacterized regulatory genome of E. coli with massively parallel reporters

تجمع هذه الدراسة بين المناهج التجريبية والنظرية لرسم الخريطة التنظيمية كمياً، بما في ذلك مواقع ارتباط عوامل النسخ والارتباطات البيئية، لأكثر من 100 جين غير مشخص من بكتيريا الإشريكية القولونية (E. coli) عبر 39 حالة متنوعة، مما يسلط الضوء على وظائف الـ "y-ome" وغيرها من العناصر الجينية ضعيفة الفهم.

Roeschinger, T., Lee, H. J., Pan, R. W., Solini, G., Faizi, K., Quan, B., Chou, T. F., Mani, M., Quake, S., Phillips, R.2026-05-11
📄 molecular biology

H2AX C-Terminal Dipeptide Truncation: A Master Switch of the DNA Damage Response.

تحدد هذه الدراسة آلية جديدة حيث يقوم إنزيم KDM4A بتحفيز بتر ثنائي الببتيد عند الطرف الكربوكسيلي لبروتين الهيستون H2AX، ليعمل فعلياً كمفتاح رئيسي يثبط استجابة تلف الحمض النووي التقليدية عن طريق منع تكوين {gamma}H2AX وتعطيل الارتباط بين إشارات الهيستون وتلف الحمض النووي.

Joseph, F. M., Holt, M. V., Jerome, J. M., Zhang, L., Boice, A. G., Castro, P. D., Aramburu, S. I., Dere, R. L., Rosenbe (…)2026-05-11
📄 molecular biology

Optimisation of Xenium automated in situ sequencing for PAXgene-fixed tissue samples

تقدم هذه الدراسة سير عمل مُحسَّنًا باستخدام بروتوكول هضم جديد يعتمد على الببسين (XTO) لتكييف منصة "Xenium" المؤتمتة للتسلسل الموضعي في الموقع بنجاح مع الأنسجة المثبتة بـ "PAXgene"، مما يثبت أن هذه العينات يمكن أن تحقق كشفًا لنسخ الحمض النووي الريبي (RNA) في الموقع يضاهي أو يتفوق على عينات "FFPE" القياسية مع الحفاظ على مورفولوجيا الأنسجة.

Roberts, K., Bassett, A. R.2026-05-10
📄 molecular biology

Subcellular Characterization of the Molecular Determinants of Ebola Virus VP40 Trafficking and Assembly

تستخدم هذه الدراسة المجهر البؤري الطيفي (confocal microscopy) وطفرات بروتين VP40 الملحقة بفلوروفور لتوصيف التوزيع تحت الخلوي ومسارات النقل لبروتين مصفوفة فيروس إيبولا، مما يكشف كيف يؤدي التجمع المعتمد على الارتباط بالغشاء والتفاعلات مع الآلية الإفرازية للمضيف إلى دفع عملية تجميع طبقة مصفوفة الفيروس.

Huth, T., Wiggenhorn, E., Khanal, S., Wan, W.2026-05-08
📄 molecular biology

LowDoseWizard - rapid and standardised setup of low-dose cryo-TEM imaging in SerialEM

تقدم الورقة البحثية LowDoseWizard، وهو سير عمل معياري وموجه ضمن برنامج SerialEM يقلل بشكل كبير من الوقت والخبرة المطلوبة لتوحيد إعدادات مجهر Cryo-TEM منخفض الجرعة، مما يتيح تهيئة سريعة تدعم جمع بيانات الجسيمات المفردة عالية الدقة.

Fromm, S. A., Mattei, S.2026-05-08
📄 molecular biology

HPV Capsid-Derived Cationic Peptides for Cargo Delivery and Antiviral Activity

تحدد هذه الدراسة الببتيدات الكاتيونية المشتقة من بروتين الغلاف L1 لفيروس الورم الحليمي البشري من النوع 16 بوصفها عوامل اختراق خلوية عالية الكفاءة قادرة على إيصال الحمولة إلى الخلايا عبر عملية الالتقام الخلوي بوساطة هيباران سلفات، وتُظهر نشاطاً مضاداً للفيروسات قوياً ضد أنواع فيروس الورم الحليمي البشري عالية الخطورة من خلال منع دخول الفيروس.

Stepanyan, V., Finnemann, S. C., Meneses, P. I.2026-05-08
📄 molecular biology

Increasing the shelf life of tomato fruit by editing the β-D-N-acetylhexosaminidase (β-hex) gene using CRISPR/Cas9 technology.

تُظهر هذه الدراسة أن استخدام تقنية CRISPR/Cas9 لتعطيل جين β-D-N-acetylhexosaminidase (β-hex) في نباتات الطماطم يساهم بنجاح في إطالة مدة صلاحية الثمار وتماسكها دون المساس بالجودة أو إدخال عناصر معدلة وراثياً.

Murodov, A. A., Ayubov, M. S., Mirzakhmedov, M. K., Obidov, N. S., Mamajonov, B. O., Yusupov, A. N., Bashirxonov, Z. H. (…)2026-05-05
📄 molecular biology

The chronology of developing cells: are epigenomic and transcriptomic oscillations linked to their linear trajectories?

تقترح هذه الورقة وتقدم دليلاً على أن المسارات التنموية الخطية في الخلايا مدفوعة ومرتبطة بتذبذبات جينية وتعبيرية متزامنة، مما يشير إلى وجود آلية أساسية لترميز الوقت الجزيئي وضمان المتانة التنموية.

Carlucci, M., Oh, E. S., Silverthorne, T., Stinchcombe, A. R., Zelnys, M., Petronis, A.2026-04-30
📄 molecular biology

Dredd-mediated cleavage of Kenny uncouples the IKK complex from selective autophagy to enable innate immunity

تكشف الدراسة أنه أثناء العدوى البكتيرية، يقوم الكاسباز "دريد" (Dredd) بشطر الوحدة الفرعية "كيني" (Kenny) المرتبطة بمستقبل الالتهام الذاتي لمركب "آي كيه كيه" (IKK)، وذلك لإزالة المنطقة المتفاعلة مع "إل سي 3" (LC3)، مما يؤدي إلى فصل المركب عن التثبيط الناجم عن الالتهام الذاتي الانتقائي وتمكين استجابات مناعية فطرية قوية تعتمد على العامل النووي كابا ب (NF-κB).

Mohan, A. K., Dahlstrom, A. M., Aalto, A. L., Kotala, K., Luukkonen, V., Serenius, F., Helin, E., Rusten, T. E., Meinand (…)2026-04-25
📄 molecular biology

Antiviral Potential of Lauric Acid against Dengue Virus 2: Evidence from a Luciferase-Based Replicon Assay

تُظهر هذه الدراسة أن حمض اللوريك يبدي نشاطاً مضاداً للفيروسات بشكل ملحوظ ضد النمط المصلِي الثاني لفيروس حمى الضنك من خلال تثبيط تضاعف الحمض النووي الريبوزي (RNA) الفيروسي وترجمته في مقايسة النسخة المكررة، على الرغم من أن إمكاناته العلاجية محدودة حالياً بسبب السمية الخلوية عند التركيزات الفعالة.

Kumari, A., Pilankatta, R., Kumari, B., Prasad, M. K., Kumar, N., KUMARI, A.2026-04-23